随着分子生物技术在生物学、医学等方面的广泛应用,RNA提取已成为研究基因表达、克隆目的基因等的一项基本试验技术。高质量RNA的提取,是后续RT-PCR、qPCR、Northern blot、cDNA文库构建等正常进行的必要前提。Trizol法是一种常见的提取总RNA的方法,在RNA得率及试剂成本方面具有一定的优势。
图1 Trizol法提取RNA流程
Trizol是一种较为流行的总RNA抽提试剂,可以直接从细胞或组织中提取总RNA。其含有苯酚、异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞并抑制细胞释放出的核酸酶,因此对于纯化RNA及标准化RNA的生产来说使用价值相对比较高。
图2
♦ Trizol是动植物细胞、组织或者细菌的总RNA抽提试剂;
♦ 主要含有苯酚、异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞并抑制细胞释放出的核酸酶。苯酚主要用于裂解细胞、变性蛋白,同时使部分RNase失活,保护RNA;异硫氰酸胍可降解细胞、溶解蛋白质,使蛋白质的二级结构消失、使核蛋白与核酸分离,进而使核内的RNA被释放出来,并且抑制RNase活性;
♦ 抽提所得RNA无DNA和蛋白污染。一般所得RNA溶于DEPC水后的A260/280值为8-2.0;
♦ 裂解细胞或和组织共匀浆时,Trizol可以保持样品中RNA的完整性,即可以有效抑制RNA的降解;
♦ 每一百万细胞用Trizol抽提可得5-15μg RNA;每毫克组织用Trizol抽提可得1-10μg RNA,产量因细胞和组织不同而异;
♦Trizol抽提所得RNA可直接用于Northern,点杂交,纯化mRNA,体外翻译,RNase protectionassay,cDNA克隆,以及RT-PCR;也可以用于基因表达芯片分析、高通量测序等对RNA质量要求较高的情况。
氯仿是分子量比较大的有机溶剂,在提取RNA时,氯仿可以有效的使有机相和无机相迅速分离。加入氯仿,离心后,样品即分成水样层(RNA存在于水样层)、中间层(DNA和蛋白质存在于中间层)和有机层。
细化它的主要作用点:
(1)作为有机溶剂变性蛋白,使其沉淀并通过离心除去,同时也通过变性作用抑制RNase活性;
(2)RNA提取试剂中通常含有苯酚(Trizol主要成分就是苯酚),苯酚微溶于水,抽提烷之后水相里有痕量的酚,如果不除去会损伤核酸,需要通过氯仿把水相里参与的苯酚抽提掉;
(3)作为溶剂抽提样品中的一些脂溶性杂质(比如油脂、脂溶性色素等),起到一定除杂作用。
异丙醇的作用主要是沉淀RNA。RNA存在于水样层中,收集水样层后可以通过异丙醇沉淀RNA来还原。离心前沉淀不可见,离心弃上清后,可见胶状的RNA沉淀。
75%乙醇主要由乙醇和DEPC水配置,主要用来洗涤粘附在RNA沉淀上的氯仿跟异丙醇。
DEPC处理水是经DEPC(即diethyl pyrocarbonate,焦碳酸二乙)处理过并经高温高压灭菌的超纯水(一级水),是一种无色液体。经检测不含杂质RNA、DNA、核酸酶和蛋白质。本产品可以用于RNA沉淀的溶解,含有RNA的各种反应体系,以及其它要求无RNase、DNase和proteinase的反应体系。
分类 | 货号 | 产品名称 | 规格 |
离心管 | abs7119 | 1.5ml离心管(无菌无酶) | 500支/盒,10盒/箱 (1袋/盒) |
abs7118 | 0.5ml离心管(无菌无酶) | 1500支/袋,10袋/箱 | |
吸头 | abs7071 | 10μL滤芯吸头(盒装 无菌无酶) | 96支/盒,100盒/箱 |
abs7074 | 200μL滤芯吸头(盒装 无菌无酶) | 96支/盒,100盒/箱 | |
abs7077 | 1000μL滤芯吸头(盒装 无菌无酶) | 96支/盒,50盒/箱 | |
abs7176 | 20μL滤芯吸头(盒装 无菌无酶) | 96支/盒,100盒/箱 | |
abs7072 | 10μL吸头(盒装 无菌无酶) | 96支/盒,100盒/箱 | |
abs7073 | 10μL吸头(袋装 无酶) | 1000支/袋,10袋/箱 | |
abs7075 | 200μL吸头(盒装 无菌无酶) | 96支/盒,100盒/箱 | |
abs7076 | 200μL吸头(袋装 无酶) | 1000支/袋,20袋/箱 | |
abs7078 | 1000μL加长吸头(盒装 无菌无酶) | 96支/盒,50盒/箱 | |
abs7079 | 1000μL吸头(盒装 无菌无酶) | 96支/盒,50盒/箱 | |
abs7080 | 1000μL吸头(袋装 无酶) | 500支/袋,10袋/箱 | |
abs7081 | 1000μL加长吸头(袋装 无酶) | 500支/袋,10袋/箱 |
一、细胞裂解
1、组织样本:
Trizol用量:每50-100mg 组织加1 ml Trizol,样品体积不应超过Trizol体积的10%。
(1)将动物或植物组织切成小块,在液氮中磨碎或用匀浆器匀浆处理;
(2)将研磨好的组织粉末快速转入装有1ml Trizol的2 ml离心管中,在涡旋振荡器上迅速振荡混匀,置于冰上,待所有的样品研磨完;
(3)裂解产物应呈澄清的透明粘稠液体。对于富含蛋白、脂肪或多糖物质的组织样品如肌肉、脂肪组织和植物结节部位等,匀浆后仍会存留有不溶物质,可于4℃ 12,000 x g 离心10min,然后吸取上清至一新的离心管中。
2、细胞样本:
(1)贴壁细胞:吸尽培养液,每10cm2培养面积(6孔板单孔或35 mm平皿)加入1ml Trizol,用加样器吹打数次,以确保细胞裂解,然后转移至离心管中。注:Trizol的使用量应由培养皿表面积决定,而非由细胞数目决定。Trizol量不足可能导致提取的RNA中有DNA污染;
(2)悬浮细胞:离心收集细胞,吸尽液体,每 5-10×106动植物或酵母细胞,或每 1×107细菌细胞加入1ml Trizol,用加样器吹打,使其裂解,然后转移至离心管中。
注:添加Trizol前切勿洗涤细胞 ,以免RNA降解。必要时可以用匀浆器来裂解某些细菌或者酵母细胞。
二、液相分离
(1)裂解产物于室温放置5min,使核酸-蛋白复合物分离;(注:此时样品可在-80℃长期保存。)
(2)每1ml Trizol加入0.2ml氯仿,盖紧管盖,剧烈振荡15s,室温放置2-3min;
(3)4℃ 12,000 x g离心15min,样品会分成三层:桔黄色的下层有机相,中间层和无色的上层水相;
(4)吸取含总RNA的上层水相至一新的离心管中,吸取水相的体积为所用Trizol试剂的60%。
三、RNA回收
(1)按照每1ml Trizol的最初使用量加入0.5ml异丙醇,颠倒数次混匀,室温放置10min;
(2)4℃ 12,000 x g 离心10min,弃除上清,可见胶状的RNA沉淀;
(3)按照每1ml Trizol的最初使用量加入1ml 75%乙醇,颠倒数次混匀,洗涤沉淀;
(4)4℃ 12,000 x g离心5min,弃除上清;
(5)室温倒置5-10min晾干或真空抽干(不要使用真空干燥离心机,以免RNA过干,难以溶解);
(6)加入适量(如25ul)DEPC-ddH2O或TE缓冲液,用加样器吹打数次溶解RNA;
(7)通过RNA电泳以及紫外分光光度计检测,确定RNA的浓度、纯度和完整性;
(8)所得的RNA应立即使用或适量分装后-80℃保存,避免反复冻融。
除以上介绍的单品Trizol(abs60154)外,还有Trizol(总RNA抽提试剂盒)(abs9331)包含有RNA提取全流程的试剂。
货号 | 产品名称 | 规格 | 包含试剂名称 | 体积 |
abs9331 | Trizol(总RNA抽提试剂盒) | 1Kit | Trizol | 100ml |
分相试剂BCP | 10ml | |||
异丙醇 | 50ml | |||
75%乙醇 | 100ml | |||
DEPC水 | 10m |
参考文献
[1]袁琳, 代亚坤, 高炳淼. 改进 TRIzol 法提取不同发育时期海葵的总RNA[J]. 贵州农业科学, 2020, 48(4): 96.
[2]Eldh M, Lötvall J, Malmhäll C, et al. Importance of RNA isolation methods for analysis of exosomal RNA: evaluation of different methods[J]. Molecular immunology, 2012, 50(4): 278-286.
[3]王华, 李华. 保存动物组织内 RNA 的方法改进[J]. 生物技术通报, 2010 (6): 152-155.
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